蛋白质结构多样性的原因
构成蛋白质结构多样性的原因:
组成蛋白质的氨基酸种类不同;
组成蛋白质数目不相同;
组成蛋白质的氨基酸排列顺序不同;
每种蛋白质分子的空间结构不相同。
结构的多样性决定了功能多样性。蛋白质是由氨基酸构成的,构成蛋白质的氨基酸有至少20种,不同的排列组合,就有了不同的蛋白质,而且空间结构也有不同。蛋白质是生命活动的基本元素,蛋白质结构的不同就导致了生理功能的不同,比如有些蛋白质有催化作用,有些有免疫作用等。
蛋白质结构的结构测定
近年来,随着结构基因组学的兴起,大量的蛋白质结构获得了测定,为研究蛋白质的作用机理提供了重要的结构信息,测定方法如下:
专门存储蛋白质和核酸分子结构的蛋白质数据库中,接近90%的蛋白质结构是用X射线晶体学的方法测定的,X射线晶体学可以通过测定蛋白质分子在晶体中电子密度的空间分布,在一定分辨率下解析蛋白质中所有原子的三维坐标;大约9%的已知蛋白结构是通过核磁共振技术来测定的,该技术还可用于测定蛋白质的二级结构;除了核磁共振以外,还有一些生物化学技术被用于测定二级结构,包括圆二色谱;冷冻电子显微技术是近年来兴起的一种获得低分辨率蛋白质结构的方法,该方法最大的优点是适用于大型蛋白质复合物的结构测定,并且在一些情况下也可获得较高分辨率的结构,如具有高对称性的病毒外壳和膜蛋白二维晶体。
蛋白质结构的结构预测
蛋白质结构预测是蛋白质的的氨基酸序列中的预测蛋白质的三维结构;蛋白质二级结构预测方法一般有:X-射线晶体学技术,核磁共振衍射技术,电子显微技术,质谱法,荧光共振能量转移技术;蛋白质三级结构预测方法一般有:同源建模法,折叠识别法,从头预测法。
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